棉花苗期（出苗至现蕾）一般40～50天，管理中心是"保全苗、促早发、育壮苗"。北方棉区多在4月中下旬播种，5月出苗，此期低温多病、易板结、易缺苗。
一、放苗与查苗补苗
- 地膜覆盖棉田：出苗后及时打孔放苗，防止晴天高温烧苗。放苗孔用土封严，增温保墒。
- 查苗：出苗后3～5天查一次，缺苗断垄地段及时催芽补种或带土移栽。
- 定苗：2～3片真叶期间苗，4～5片真叶时定苗，每穴留单株。
二、中耕松土与蹲苗
苗期连续中耕3～4次，深度由浅到深（3～5厘米→8～10厘米），破除板结、提高地温、清除杂草。雨后必锄，地板结必锄。苗期一般不浇水、不追肥，进行蹲苗促根。
三、苗期病虫害防治
- 病害：立枯病、猝倒病、炭疽病，可用多菌灵或恶霉灵灌根。
- 虫害：地老虎、蚜虫、蓟马、红蜘蛛，用种衣剂包衣或苗期喷药。
- 棉蚜：卷叶前用吡虫啉或啶虫脒喷雾。
- 地老虎：傍晚喷氯虫苯甲酰胺或撒毒饵。
四、弱苗升级
对板结、渍水、低温造成的弱苗，可追施"提苗肥"，亩施尿素3～5公斤或腐熟人粪尿，结合浅中耕，促弱转壮。
常见误区是放苗不及时烧苗，或定苗过晚造成苗挤苗。应"早放苗、早定苗、勤中耕"。